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Cadre de détection comprimée pour l’identification des isoformes d’expression différentielle et d’aberrations transcriptomiques dans des échantillons de cancer

État: 
Précédent
Concours: 
Concours 2012 en bio-informatique et en génématique
Secteur: 
Santé
Centre(s) de génomique:
Genome British Columbia
Directeur or directrice de projet:
Cenk Sahinalp (Université Simon Fraser), Colin Collins (Université de la Colombie-Brittanique)
GE3LS: 
Non
Année de lancement: 
2013-2014
Résumé: 

La nouvelle technologie fournit des moyens rapides et exacts pour analyser l’ARN (qui agit comme messager porteur d’instructions de l'ADN) qui code les protéines dans un tissu. Il peut y avoir de nombreux produits de l’ARN dans un gène, mais on croit qu'il suffit d’en identifier et d’en quantifier un petit nombre pour connaître le contenu en ARN d'un échantillon.

MM. Cenk Sahinalp et Colin Collins, de même que l’équipe sous leur direction, utilisent une technique de calcul appelée détection comprimée pour trouver le plus petit nombre possible de produits de l’ARN dans chaque gène. Leur approche aidera également à préciser les différences essentielles entre des échantillons de produits d’ARN du même gène.