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Externalisation ouverte des bases de données génomiques

État: 
Actuel
Concours: 
Concours 2015 en bio-informatique et en génématique
Secteur: 
Santé
Centre(s) de génomique:
Génome Québec, Genome Prairie
Directeur or directrice de projet:
Jérôme Waldispühl (Université McGill), Olivier Tremblay-Savard (Université du Manitoba)
Année de lancement: 
2016-2017
Résumé: 

Les vastes ensembles de données génomiques, les annotations et les connaissances approfondies en biologie, qui sont accessibles en ligne, représentent une source d'information essentielle ayant grandement contribué à l'expansion rapide de ce domaine. Afin qu'elles demeurent pertinentes pour la recherche d'aujourd'hui, ces ressources exigent une maintenance continue et doivent être constamment mises à jour avec de nouveaux renseignements biologiques. Malgré leur contribution fondamentale au pipeline de découvertes, on observe une baisse du soutien pour les principales bases de données génomiques.

Jérôme Waldispühl (Université McGill) et Olivier Tremblay-Savard (Université du Manitoba) travaillent à l'intégration des bases de données génomiques dans les réseaux sociaux en développant une plateforme d'externalisation ouverte Web et mobile pour la gestion, la maintenance et l'actualisation de ces bases de données. Le système sera adapté aux étudiants et aux enseignants des écoles secondaires et des universités. La mise en œuvre de ce projet permettra de démontrer les vastes répercussions de l'externalisation ouverte sur la résolution des défis financiers ou techniques considérables auxquels on fait face en ce qui a trait au maintien des ressources clés en recherche biologique.