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Intervention rapide contre la pandémie de COVID-19 améliorée par la génomique

État: 
Actuel
Concours: 
Initiative régionale génomique sur la COVID-19
Secteur: 
Santé
Centre(s) de génomique:
Genome Alberta
Directeur or directrice de projet:
Matthew Croxen (University of Alberta), Linda Chui (University of Alberta)
GE3LS: 
Non
Année de lancement: 
2020-2021
Résumé: 

En date du 21 avril 2020, il y a plus de 2,5 millions de cas de COVID-19 dans le monde, dont 40 000 au Canada. On s’attend à ce que la COVID-19 soit directement responsable de la mort de beaucoup plus de personnes, mais comprendre la propagation du virus contribuera aux efforts d’atténuation. Les mutations sont courantes et attendues dans les génomes du coronavirus. Nous pouvons tirer parti de ces mutations pour suivre la propagation des virus dans la communauté, et ainsi fournir des renseignements d’importance vitale pour la santé publique sur la propagation et les sources potentielles de la maladie. Au moment de la rédaction, il y a plus de 3 095 cas en Alberta. Afin d’accélérer la production de cette information génétique, nous travaillerons avec le Centre for Health Genomics and Informatics (CHGI) de l’University of Calgary pour générer rapidement des séquences génétiques de plus de 1 900 de ces virus (nous prévoyons d’autres cas avec le temps). Entre-temps, nous validerons aussi les méthodes automatisées pour séquencer rapidement les génomes viraux au laboratoire de santé publique de façon continue. Ce processus d’automatisation peut être déployé dans d’autres laboratoires à travers le monde. L’information génétique que nous générons à partir des virus de la COVID-19 de l’Alberta sera analysée conjointement avec des milliers d’autres virus de la COVID-19 de partout dans le monde. Ces informations aideront la santé publique à mieux comprendre la dynamique de la propagation virale en Alberta; on pourra ainsi élaborer des politiques plus efficaces pour empêcher la maladie de se propager, et fournir de l’information importante pour le diagnostic ainsi que pour la mise au point de traitements et de vaccins.