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Méthodes génématiques et bases de données permettant d'identifier les petites molécules de liaison à l'ARN qui régulent l'expression génétique

État: 
Actuel
Concours: 
Concours 2015 en bio-informatique et en génématique
Secteur: 
Santé
Centre(s) de génomique:
Génome Québec
Directeur or directrice de projet:
Jérôme Waldispühl (Université McGill), Nicolas Moitessier (Université McGill)
GE3LS: 
Non
Année de lancement: 
2016-2017
Résumé: 

L'ARN messager (ARNm) désigne des molécules d'ARN qui transportent les messages de l'ADN dans le cadre de l'expression génétique. Les riborégulateurs, qui n'ont été découverts qu'en 2002, semblent être une classe ancienne, mais répandue, d'éléments de l'ARNm. L'un de ces riborégulateurs, le riborégulateur activé par la flavine mononucléotide (FMN), offre une cible prometteuse pour les antibiotiques. Ce riborégulateur joue un rôle essentiel dans la production de la riboflavine (ou vitamine B2) chez les bactéries, mais non chez les humains. L'activation du riborégulateur FMN bactérien pourrait donc interrompre cette voie biosynthétique et empêcher la croissance des bactéries, sans avoir d'incidence sur la santé humaine. Il est très probable que plusieurs autres riborégulateurs pourraient être des cibles potentielles pour de nouvelles petites molécules thérapeutiques. Il reste toutefois à les découvrir, ainsi qu'à découvrir les petites molécules qui s'y fixent.

Cependant, la recherche de petites molécules peut être un processus long et fastidieux. Le criblage virtuel à haut débit est un procédé à la fois plus rapide et moins coûteux que toute autre approche expérimentale. Les professeurs Jérôme Waldispühl et Nicolas Moitessier, tous deux de l'Université McGill, sont à mettre au point l'infrastructure et la technologie computationnelles nécessaires pour le criblage du génome entier des éléments des riborégulateurs et pour l'identification de petites molécules nouvelles qui les activent.