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Gouvernance du RCanGéCO

RCanGéCO

Le Réseau canadien de génomique COVID (RCanGéCO) est un consortium dirigé par Génome Canada et composé des autorités de santé publique fédérales, provinciales et régionales du Canada, de leurs partenaires en soins de santé, d’universités, de l’industrie, d’hôpitaux, d’instituts de recherche et de centres de séquençage à grande échelle. Ce Réseau s’est formé pour effectuer le séquençage génomique à grande échelle et l’analyse des génomes du SARS-CoV-2 et des génomes hôtes au Canada pour comprendre et suivre la pandémie de COVID-19 et y réagir, tant à l’échelle nationale qu’internationale.

Génome Canada est reconnaissant au gouvernement du Canada de son soutien, car son financement appuie notre mission et constitue notre principal investissement dans nos projets de recherche. Le gouvernement du Canada a également investi 40 millions de dollars en avril 2020 spécifiquement pour le RCanGéCO.

Le tableau suivant illustre la solide structure de gouvernance actuellement en vigueur au RCanGéCO. Cliquez sur un comité pour en savoir plus à son sujet et en connaître les membres.

Génome Canada et les six centres régionaux

Génome Canada a la responsabilité ultime de la gérance du RCanGéCO et veille à ce que le Réseau atteigne ses objectifs et franchisse les étapes prévues. En collaboration avec les six centres de génomique régionaux, Génome Canada s’assure que le RCanGéCO respecte les modalités de l’entente conclue avec le gouvernement fédéral et fournit de l’information et des données qui permettent une évaluation constante des progrès, dont les données des indicateurs de rendement et les rapports financiers desquels dépendra le versement des fonds au RCanGéCo. Catalina Lopez-Correa, M.D., Ph. D., de Génome Canada, est directrice exécutive de l’initiative du RCanGéCO.  

Comité directeur

Le Comité directeur du RCanGéCo veille à la gestion générale du Réseau et à la coordination des activités au sein des projets du séquençage du virus (VirusSeq) et du séquençage des hôtes (HostSeq) et entre ces derniers, de même qu’à l’harmonisation avec ces projets et d’autres initiatives externes.

Membres

Lorne Hepworth, ex-président et PDG de CropLife Canada (président)

Kenneth Baillie, consultant et chercheur universitaire principal (clinique), The University of Edinburgh

Bettina  Hamelin, présidente-directrice générale d’Ontario Genomics

Cindy Bell, vice-présidente exécutive, Développement corporatif, Génome Canada

Ewan Harrison, Cambridge Infectious Diseases, Faculté de médecine, University of Cambridge

Duncan MacCannell, CDC SPHERES, dirigeant scientifique principal, Office of Advanced Molecular Detection, Centers for Disease Control and Prevention

Chris McMaster, directeur scientifique, Institut de génétique des IRSC

Allison McGeer, consultante en maladies infectieuses, Hôpital Mount Sinaï, University of Toronto

Eric Meslin, président-directeur général, Conseil des académies canadiennes

Howard Njoo, sous-administrateur en chef de la santé publique, ASPC; professeur associé, École d’épidémiologie et de santé publique, Université d’Ottawa

Joris Veltman, doyen, Institut des sciences biologiques, University of Newcastle

Comité de coordination

Le Comité de coordination du RCanGéCO travaille en concertation avec les deux comités de mise en œuvre pour coordonner la gestion et l’échange des données de génomique et des métadonnées. Il assurera aussi la liaison avec d’autres projets nationaux et internationaux en matière de données.

La composition du Comité directeur est souple et peut changer occasionnellement.

Membres

Catalina Lopez-Correa, directrice exécutive, RCanGéCO, Génome Canada (présidente)

Naveed Aziz, directeur général, dirigeant scientifique en chef, CGEn

Cindy Bell, vice-présidente exécutive, Développement corporatif, Génome Canada

Fiona Brinkman, professeure distinguée, Biologie moléculaire et biochimie; professeure agrégée, School of Computing Science et Faculty of Health Sciences, Simon Fraser University

William Hsiao, professeur agrégé, Faculty of Health Sciences et Molecular Biology and Biochemistry, Simon Fraser University

Yann Joly, directeur de la recherche au Centre de génomique et politiques; professeur agrégé, Département de génétique humaine de la Faculté de médecine avec nomination conjointe à l’Unité de bioéthique de l’Université McGill

Steven Jones, professeur, codirecteur et chef de la Bio-informatique, Michael Smith Genome Sciences Centre, BC Cancer Agency; professeur de génétique médicale, The University of British Columbia; professeur, Biologie moléculaire et biochimie, Simon Fraser University

Sandrine Moreira, responsable de la génomique et de la bio-informatique, Institut national de santé publique du Québec

Samira Mubareka, médecin spécialiste des maladies infectieuses et virologue, Sunnybrook Health Sciences Centre & Research Institute

Natalie Prystajecky, Programme de microbiologie environnementale du Laboratoire de santé publique du BCCDC; professeure, Département de pathologie et de médecine de laboratoire, The University of British Columbia

Terrance Snutch, professeur, Michael Smiths Laboratories, The University of British Columbia

Lisa Strug, chercheuse principale, Programme de génétique et de biologie du génome, SickKids; codirectrice, Centre for Applied Genomics; professeure agrégée de biostatistique, Dalla Lana School of Public Health, University of Toronto

Gary Van Domselaar, scientifique en chef, Bio-informatique, Laboratoire national de microbiologie, Agence de la santé publique du Canada

Ma’an Zawati, professeur adjoint; directeur exécutif, Centre de génomique et politiques, Université McGill

Comité de mise en œuvre du projet VirusSeq du RCanGéCO

Le Comité de mise en œuvre du projet VirusSeq du RCanGéCO assure la gestion générale du projet afin d’assurer sa mise en œuvre efficiente, efficace, éthique et équitable partout au pays et rend compte au Comité directeur par l’entremise de son président.

Membres

Terrance Snutch, professeur, Michael Smiths Laboratories, The University of British Columbia (président)

Cindy Bell, vice-présidente exécutive, Développement corporatif, Génome Canada

Fiona Brinkman, professeure distinguée, Biologie moléculaire et biochimie; professeure agrégée, School of Computing Science et Faculty of Health Sciences, Simon Fraser University

Marceline Côté, professseure agrégée, Département de biochimie, de microbiologie et d’immunologie, Université d’Ottawa

William Hsiao, professeur agrégé, Faculty of Health Sciences et Molecular Biology and Biochemistry, Simon Fraser University

Yann Joly, directeur de la recherche au Centre de génomique et politiques; professeur agrégé, Département de génétique humaine de la Faculté de médecine avec nomination conjointe à l’Unité de bioéthique de l’Université McGill

Sharmistha Mishra, chercheuse clinicienne, Li Ka Shing Knowledge Institute et Division of Infectious Disease, St. Michael’s Hospital

Sandrine Moreira, responsable de la génomique et de la bio-informatique, Institut national de santé publique du Québec

Samira Mubareka, médecin spécialiste des maladies infectieuses et virologue, Sunnybrook Health Sciences Centre & Research Institute

Jared Simpson, professeur adjoint, Department of Computer Science, et chercheur, IORC, University of Toronto

Megan Smallwood, gestionnaire de programme, Génome Canada

Gary Van Domselaar, scientifique en chef, Bio-informatique, Laboratoire national de microbiologie, Agence de la santé publique du Canada

Comité de mise en œuvre du projet HostSeq du RCanGéCO

Le Comité de mise en œuvre du projet HostSeq du RCanGéCO assure la gestion générale du projet afin d’assurer sa mise en œuvre efficiente, efficace, éthique et équitable partout au pays et rend compte au Comité directeur par l’entremise de son président.

Membres

Naveed Aziz, directeur général et dirigeant scientifique en chef, CGEn (président)

Steven Jones, chef, Bio-informatique, BC Cancer Agency (président, Sous-comité du stockage et de l’échange des données)

Bartha Knoppers, directrice, Centre de génomique et politiques, Faculté de médecine, Université McGill

Mark Lathrop, chaire de recherche du Canada en génomique médicale, Université McGill

Stephen Scherer, directeur, The Centre for Applied Genomics et McLaughlin Centre, The Hospital for Sick Children et University of Toronto

Lisa Strug, chercheuse principale, Programme de génétique et de biologie du génome; Chaire de recherche du Canada (niveau 1) en sciences des données génomiques, The Hospital for Sick Children (présidente, Sous-comité de l’épidémiologie génétique)

Stuart Turvey, chaire de recherche du Canada en médecine pédiatrique de précision, BC Children's Hospital Institute (président, Sous-comité du recrutement pour les études)


Groupes de travail du projet VirusSeq

Groupe de travail sur le renforcement des capacités du RCanGéCO

Le projet VirusSeq du RCanGéCO doit, entre autres résultats stipulés, mener au renforcement de la capacité nationale qui permettra de faire face à la deuxième vague attendue de COVID-19 et aux pandémies futures. Cette obligation vise les 13 laboratoires provinciaux et territoriaux de santé publique du Canada. On reconnaît également que certains sites de séquençage situés en milieu hospitalier auront besoin d’une petite part du renforcement des capacités pour affronter la deuxième vague prévue de COVID-19.

Membres

Gary Van Domselaar (président)

Matthew Croxen

Natalie Knox

Celine Nadon

Jennifer Tanner

Groupe de travail sur l’analyse des métadonnées

Les données du séquençage génomique et les métadonnées qui les accompagnent, produites dans le cadre du projet, serviront à la surveillance génomique et à l’intervention contre la COVID-19, tant pour l’instance nationale que les instances provinciales et territoriales en santé. Ces activités comprennent les analyses des séquences aux fins d’évaluation/de contrôle de la qualité, le suivi de la transmission internationale et interprovinciale, la détermination de la lignée cellulaire, le dépistage de grappes de cas et la surveillance des variantes qui peuvent influencer la gravité ou la transmissibilité de la maladie. Pour appuyer ces activités, le Laboratoire national de microbiologie de l’Agence canadienne de la santé publique coordonnera le stockage, la gestion, l’analyse et l’échange de données de séquences génomiques de haute qualité et des métadonnées connexes, conjointement avec les laboratoires provinciaux de santé publique et les partenaires en soins de santé.

Membres

Gary Van Domselaar (président)

Fiona Brinkman (coprésidente)

Zohaib Anwar

Robert Beiko

Matieu Bourgey

Guillaume Bourque

Ahmed Draia

Jun Duan

Marc Fiume

Dan Fornika

Eric Fournier

Erin Gill

Paul Gordon

Emma Griffiths

Jose Hector Galvez Lopez

Darian Hole

Will Hsiao

Jeffrey Joy

Kimia Kamelian

Natalie Knox

Philip Mabon

Finlay Maguire

Tom Matthews

Andrew McArthur

Samir Mechai

Sandrine Moreira

Art Poon

Amos Raphenya

Claire Sevenhuysen

Jared Simpson

Jennifer Tanner

Lauren Tindale

John Tyson

Geoff Winsor

Nolan Woods

Groupe de travail sur l’éthique et la gouvernance

Le projet Virus-Seq du RCanGéCo se concentre sur les pratiques rapides, transparentes et équitables d’échange des données, conformément à la réglementation et aux normes canadiennes en matière de respect de la vie privée et d’éthique. Nous envisageons trois objectifs pour l’échange des données : 1) l’échange public des données pour permettre une intervention mondiale contre la pandémie; 2) l’échange des données dans l’ensemble du système de santé canadien pour assurer une surveillance nationale; et 3) l’échange de données avec des chercheurs autorisés afin de promouvoir la recherche-développement scientifique et médicale. Le modèle de gouvernance qui s’appliquera aux données échangées sous chaque objectif sera soigneusement élaboré pour faire l’équilibre entre la protection de la vie privée et les progrès scientifiques.

Membres

Yann Joly (président)

Fiona Brinkman

Erin Gill

Will Hsiao

Hanshi Liu

Sharmistha Mishra

Sandrine Moreira

Gary Van Domselaar

Groupe de travail sur les métadonnées

Pour maximiser l’impact et l’utilité des données de séquençage, il faut les associer aux données épidémiologiques et cliniques, à celles des laboratoires et à d’autres données contextuelles (« métadonnées »). Pour mieux harmoniser le système de santé publique canadien multijuridictionnel et les efforts nationaux et mondiaux, c’est-à-dire intégrer les métadonnées dans un format uniforme et utilisable dans une enquête sur les éclosions de COVID-19 et les activités d’intervention, le projet VirusSeq aura également pour fonction indispensable de spécifier et de conserver les métadonnées, tout en coordonnant les activités avec le projet HostSeq.

Membres

William Hsiao (président)

David Alexander

Zohaib Anwar

Nathalie Bastien

Tim Booth

Guillaume Bourque

Fiona Brinkman

Hughes Charest

Caroline Colijn

Matthew Croxen

Guillaume Desnoyers

Rejean Dion

Damion Dooley

Ana Duggan

Leah Dupasquier

Kerry Dust

Nahuel Fittipaldi

Eleni Galanis

Emma Garlock

Greg German

Erin Gill

Gurinder Gopal

Tom Graefenhan

Morag Graham

Emma Griffiths

Linda Hoang

Naveed Janjua

Jeffrey Joy

Kimia Kamelian

Lev Kearney

Natalie Knox

Theodore Kuschak

Jason LeBlanc

Yan Li

Anna Majer

Adel Malek

Dionne Marcino

Ryan McDonald

David Moore

Celine Nadon

Samir Patel

Natalie Prystajecky

Anoosha Sehar

Claire Sevenhuysen

Garrett Sorensen

Laura Steven

Lori Strudwick

Marsha Taylor

Shane Thiessen

Gary Van Domselaar

Adrian Zetner

Groupe de travail sur les collaborations de recherche

Pour tirer profit des outils d’avant-garde et de la mise au point des analyses dans ce domaine de recherche en évolution rapide, il est indispensable de travailler en concertation avec la grande communauté des chercheurs. La sensibilisation de chercheurs de divers horizons visera à inclure tous les pays, à refléter des projets nationaux et/ou locaux, à engager différents secteurs (recherche universitaire, recherche industrielle, etc.) et à conclure des partenariats internationaux. Des collaborations de recherche sont envisagées dans des domaines comme les méthodes de séquençage, l’analyse des données, la modélisation, la bio-informatique, l’harmonisation des données, l’échange des données, l’éthique et autres domaines pertinents qui correspondent aux buts du projet VirusSeq.

Membres

Fiona Brinkman (présidente)

Zohaib Anwar

Marceline Côté

Marc Fiume

Laura Gilbert

Erin Gill

Paul Gordon

Yann Joly

Sandrine Moreira

Samira Mubareka

Natalie Prystajecky

Jennifer Tanner

Gary Van Domselaar

Phot Zahariadis

Groupe de travail sur le séquençage

Le projet VirusSeq du RCanGéCO a pour but important d’utiliser le séquençage pangénomique du virus pour orienter les décisions de santé publique en renseignant les autorités sur la propagation et l’évolution du virus SARS-CoV-2. Pour simplifier la production, les analyses et l’échange des données, le projet VirusSeq se concentre sur l’optimisation des laboratoires expérimentaux et des protocoles et l’élaboration de méthodologies. Ces protocoles et ces méthodes nous aideront à atteindre l’objectif de séquençage de quelque 100 000 génomes viraux.

Membres

Jared Simpson (président)

Terrance Snutch (coprésident)

Patryk Aftanas

Matthew Croxen

Hooman Derakhshani

Nahuel Fittipaldi

Morag Graham

Andrew McArthur

Sandrine Moreira

Samira Mubareka

Natalie Prystajecky

Ioannis Ragoussis

Michael Surette

John Tyson


Sous-comités du projet HostSeq

Sous-comité du recrutement pour les études du projet HostSeq

Le Sous-comité du recrutement pour les études veillera à ce que les échantillons utilisés dans le projet HostSeq proviennent d’un large réseau de chercheurs/cliniciens du Canada dont les travaux portent sur divers aspects de la COVID-19. Tous les efforts sont mis en œuvre pour garantir la représentation des groupes sous-représentés et des minorités, notamment, mais sans s’y limiter, les populations autochtones et éloignées.

Membres

Stuart Turvey, BC Children's Hospital Research Institute (président)

Laura Arbour, The University of British Columbia

Naveed Aziz, CGEn

Francois Bernier, University of Calgary

Catherine Biggs, The University of British Columbia

Peter Kannu, University of Alberta

David Kelvin, Dalhousie University

Brent Richard, Université McGill

Sous-comité du stockage et de l’échange des données du projet HostSeq

Le Sous-comité du stockage et de l’échange des données élabore un plan complet de stockage et d’échange des données de séquençage du projet HostSeq, de même que des données phénotypiques connexes par le biais d’une banque de données de CGEn accessible aux chercheurs de tout le Canada et liée à d’autres ensembles de données pertinents d’ailleurs dans le monde. Le Sous-comité contribuera à la création d’une infrastructure qui facilitera le stockage, l’échange et la gestion de gros volumes de données de séquençage des génomes et de métadonnées connexes.

Membres

Steven Jones, Michael Smith Genome Sciences Centre, BC Cancer Agency; The University of British Columbia; Simon Fraser University (président)

Inanc Birol, The University of British Columbia

Guillaume Bourque, Université McGill

Lisa Strug, Hospital for Sick Children, Toronto

Joe Whitney, Hospital for Sick Children

Sous-comité de l’épidémiologie génétique – Données du projet HostSeq

Le Sous-comité de l’épidémiologie génétique guidera les mises à jour des données à mesure que les chercheurs en apprendront plus sur la maladie et qu’ils mettront au jour de nouveaux facteurs de confusion et nous aidera à coupler les données. Les membres de ce groupe ont beaucoup contribué à définir le formulaire d’exposé de cas du projet HostSeq.

Membres

Lisa Strug, SickKids; University of Toronto (présidente)

Jennifer Brooks, Institut canadien des sciences statistiques

Shelley Bull, Institut canadien des sciences statistiques, Ontario

Lloyd Elliott, Simon Fraser University

France Gagnon, Dalla Lana School of Public Health

Celia Greenwood, Université McGill

Rayjean Hung, Lunenfeld-Tanenbaum Research Institute

Jerry Lawless, University of Waterloo

Andrew Paterson, Hospital for Sick Children

Lei Sun, University of Toronto


Le financement du RCanGéCO est versé par l’entremise du ministère de l’Innovation, des Sciences et du Développement économique (ISDE) du gouvernement du Canada.