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Tests de COVID-19 à haut débit rigoureux utilisant le séquençage de nouvelle génération (SNG) : répondre au besoin urgent de capacités de test à grande échelle au sein des communautés

État: 
Actuel
Concours: 
Initiative régionale génomique sur la COVID-19
Secteur: 
Santé
Centre(s) de génomique:
Genome Atlantic
Directeur or directrice de projet:
Nikhil Thomas (Dalhousie University), John Archibald (Dalhousie University), Morgan Langille (Dalhousie University)
GE3LS: 
Non
Année de lancement: 
2020-2021
Résumé: 

Au Canada, les capacités des tests de dépistage de la COVID-19 sont presque à saturation dans le cadre de l’approche actuelle, et les chaînes d’approvisionnement des principaux réactifs sont très sollicitées. Pour l’instant, la priorité de la santé publique est de tester les personnes symptomatiques et les contacts étroits. Cette approche standard de soins très valorisée et validée ne permet toutefois pas d’identifier rapidement les propagateurs présymptomatiques ou asymptomatiques du virus. Comme le virus SRAS-Cov-2 est très contagieux, les difficultés opérationnelles rendent la détection et le confinement de la COVID-19 très difficile au sein de la population canadienne. Le médecin en chef du Canada a indiqué qu’il était urgent d’augmenter la capacité de dépistage de la COVID-19, et les épidémiologistes recommandent fortement d’accroître les capacités de tests pour guider les efforts collectifs de prévention des infections. L’objectif global par de nombreuses mesures d’atténuation est de réduire le taux de reproduction (valeur R) de la COVID-19 à moins d’un. Des tests à grande échelle, l’isolement et la recherche de contacts sont essentiels pour réduire l’impact des vagues futures de la COVID-19, au moins jusqu’à ce qu’un vaccin efficace soit disponible. Nous proposons de mettre à l’essai un protocole novateur qui tire profit de moins d’étapes d’extraction d’échantillons et d’un potentiel de mise à l’échelle massive grâce à l’utilisation de codes à barres moléculaires de l’ADN.